新闻中的新冠病毒核酸检测方法到底是什么? - HLA基因检测新闻
国务院联防联控机制于2月17日召开新闻发布会。对于目前核酸检测试剂检测率不稳定的问题,北大一院主任医师王贵强解释,核酸检测本身的稳定性是很好的。出现一些所谓检不出的情况或者假阴性的情况,主要原因是任何检测方法都有一个敏感性的问题。
核酸检测,是指通过特殊的技术手段检测临床样本中是否存在特定的病原体核酸,从而诊断患者的感染原因。此次新冠病毒是单链RNA病毒,根据《新冠病毒感染的肺炎诊疗方案(试行第五版)》(下文简称诊疗方案)建议,针对疑似病例的确诊,需要具备以下病原学证据之一者,即为确诊病例:
呼吸道标本或血液标本实时荧光RT-PCR检测新型冠状病毒核酸阳性;
呼吸道标本或血液标本病毒基因测序,与已知的新型冠状病毒高度同源;
诊疗方案中提到了两种检测方式,实时荧光RT-PCR和基因测序。小编分别为大家做简要介绍:
实时荧光RT-PCR,即实时荧光反转录聚合酶链式反应。它首先将提取的病毒基因组RNA,通过反转录变成互补DNA(cDNA)。然后再用病原体特异性的引物,以cDNA作为模板扩增病原体核酸序列。因为扩增的过程中荧光染料能同步整合在产物上,所以研究者可以通过荧光信号的强弱,进行实时检测。
基因测序是目前使用最为广泛的叫新一代测序(Next generation sequencing,NGS)(后面简称NGS技术)。我们比较熟悉的无创产前检测(NIPT)使用的就是这项技术。在新冠病毒诊断中,NGS技术首先将病毒RNA制备成测序仪可以识别和分析的DNA文库,然后在测序仪上同时对数以百万计的核酸序列进行检测。检测结果经生物信息学软件处理,最后向我们展现出病毒相关序列信息。相比2003年SARS疫情花了2-3个月确定病原体,中国科学家在此次武汉疫情爆发短短2-3周内,就通过基因测序的方法鉴定出新型冠状病毒,并成功绘制出其全基因组序列信息。这项技术的巨大成功,不仅使国内诊断企业能快速研发用于新冠病毒诊断的实时荧光RT-PCR试剂盒,更向全世界展示了中国有先进的技术能力帮助政府有效地掌握并控制疫情。即使到了疫情攻坚战的此刻,NGS技术仍然在解析第二代、第三代病毒变异情况和追踪病毒起源及演化方面,扮演着不可替代的核心作用。
央广记者也曾到中部战区总医院疾病预防控制科加强型生物安全二级负压实验室,实地探访了新冠病毒核酸检测流程。
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